Il 3º Reparto “Pianificazione dello Strumento Aerospaziale”, ha come compito quello di formulare gli indirizzi per la preparazione e l'impiego dello strumento aerospaziale, concorrere alla definizione della politica di sicurezza e difesa nazionale e curare gli aspetti connessi con la cooperazione tecnico-militare della F.A. in ambito internazionale.
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Dal Capo del 3° Reparto dipende il Centro di Eccellenza per Aeromobili a Pilotaggio Remoto (CDE APR) di Amendola (Foggia) e la R.A.MI. (Rappresentanza Aeronautica Militare) EAG (European Air Group) di High Wycombe (Regno Unito).