Il Comando della Squadra Aerea (C.S.A.) è l'Alto Comando gerarchicamente sovraordinato ai Reparti ed alle Unità operative periferiche dell'A.M. (Comandi Intermedi, Brigate, Stormi, Aeroporti,  Gruppi Volo, Gruppi Radar, Unità missilistiche, ecc.). Tale Alto Comando ha il compito di approntare ed addestrare i Reparti e le Unità operative affinché acquisiscano e mantengano i livelli di prontezza, capacità operativa e correlata autonomia logistica, necessari al conseguimento degli obiettivi definiti dalla Forza Armata. Svolge inoltre le funzioni di impiego operativo dei Reparti attraverso la struttura del Comando Operazioni Aeree (COA), integrata nel sistema C2 (Comando e Controllo) interforze ed interoperabile in ambito alleato ed internazionale, in aderenza alle direttive ed alle pianificazioni operative del Capo di Stato Maggiore della Difesa e NATO.